99版50元主色调为绿色，票幅长150mm、宽70mm。正面主景为毛泽东头像，左侧为花卉图案，票面左上方为中华人民共和国“国徽”图案，右下方为盲文面额标记。背面主景为“布达拉宫”图案，票面右上方为“中国人民银行”汉语拼音字母和蒙、藏、维、壮四种民族文字的“中国人民银行”字样和面额。
99版人民币50元防伪特征：
1、固定人像水印：位于正面左侧空白处，迎光透视，可见与主景人像相同、立体感很强的毛泽东头像水印。
2、红、蓝彩色纤维：在票面上，可看到纸张中不规则分布着红色和蓝色纤维。
3、磁性缩微文字安全线：钞票纸中的安全线，迎光观察，可见“RMB50”的缩微文字，仪器检测有磁性。
4、手工雕刻头像：正面主景毛泽东头像，采用手工雕刻凹版印刷工艺，形象逼真、传神，凹凸感强，易于识别。
5、隐形面额数字：正面右上方有一装饰性图案，将钞票置于与眼睛接近平行的位置，面对光源作平面旋转45度或90度角度，即可看到面额“50”字样。
6、胶印缩微文字：正面上方图案中，多处印有胶印缩微文字，在放大镜下可看到“50”和“RMB50”字样。
7、光变油墨面额数字：正面左下方“50”字样，与票面垂直角度观察为金色，倾斜一定角度则变为绿色。
8、阴阳互补对印图案：票面正面左下方和背面右下方均有圆形局部图案，迎光观察，正背图案重合并组成一个完整的古钱币图案。
9、雕刻凹版印刷：正面主景是毛泽东头像、中国人民银行行名、盲文及背景主景“布达拉宫”等均采用雕刻凹版印刷，用手指触摸有明显凹凸感。
10、横竖双号码：正面横竖双号码。横号码为黑色，竖号码为红色。
因99版50元发行的时间比较短，从2001年9月1日发行后，到2004年7月30日改版，只有2、3年的时间。只发行了78个冠号，是99版人民币中冠号最少的一种。在现在的流通领域中，很难找到99版50的影子。
99版50元纸币的色彩、盲文、阴阳古钱币、白水印等都存在着不合理性。再加上投资、收藏、礼品的消耗，足以使它身价倍增。99版50元纸币是我国首次完成独立设计与印制的钱币之一。目前第五套人民币16张大全套四同号销售火爆，99版50元存世量不大，所以，它未来肯定会是99版人民币中的珍品之一。
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